谢先荣

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博士、副研究员，硕士研究生导师。主要从事水稻穗发育的调控网络，以及基因编辑分析技术的开发与遗传改良应用。主持国家自然科学基金、国家重点研发子课题、广东省自然科学基金等8项。以第一作者在National Science Review、Molecular Plant、Journal of Experimental Botany、Science China-Life Sciences等发表SCI论文多篇。申请发明专利3项，软件著作权5项，获大北农科技奖基因工程奖1项（第3）。开发了应用于基因编辑设计分析的 DSDecode 软件以及一站式基因编辑软件包 CRISPR-GE（http://skl.scau.edu.cn/）。

工作经历

2016-2018，华南农业大学，作物学流动站，博士后 

主要研究领域

1. 水稻穗发育的调控网络；

2. 基因编辑分析系统开发和遗传改良应用。

主持的科研课题

1. 高通量基因编辑结果分析与靶点设计平台研发，国家重点研发子课题，主持，2024-01-01至2025-12-31，在研；

2. OsPT1控制水稻每穗粒数的分子机制，“作物学”学科建设专项子课题，主持，2022-01-01至2025-12-31，在研；

3. 水稻粒长基因GL3n的克隆和分子机制研究，国家自然科学基金面上项目，主持，2022-01-01至2025-12-31，在研；

4. 稻属杂种不育基因座位的起源演化机制及其与物种形成的关系，国家自然科学基金重大项目子课题子任务，主持，2020-01-01至2024-12-31，在研；

5. 水稻粒型调控的顺反组研究，广州市科技局，主持，2022-04-06至2024-3-31，结题；

6. 水稻雄性生殖发育必需基因ALDH2b的作用机理，国家自然科学基金青年项目，主持，2018-01-01至2020-12-31，结题；

7. 水稻雄性不育突变体ms5的基因克隆和功能研究，广东省自然科学基金，主持，2017-05-01至2020-04-30，结题；

8.  ALDH2b基因在水稻雄性生殖发育中的功能研究，博士后科学基金面上项目，主持，2016-08-01至2018-01-31，结题。

发表论文

1. 李福权，张瑞祥，赵哲，陈乐天，谢先荣^*. 基因编辑设计和分析辅助工具的研究进展. 科学通报, 2024.

2. Li S, Luo Y, Wei G, Zong W, Zeng W, Xiao D, Zhang H, Song Y, Hao Y, Sun K, Lei C, Guo X, Xu B, Li W, Wu Z, Liu Y, Xie X^*, Guo J^*. Improving yield-related traits by editing the promoter of the heading date gene Ehd1 in rice. Theor Appl Genet. 2023 Nov 6;136(12):239.

3.  Xie X^*, Li F, Tan X, Zeng D, Liu W, Zeng W, Zhu Q, Liu YG^#. BEtarget: A versatile web-based tool to design guide RNAs for base editing in plants. Comput Struct Biotechnol J. 2022, 20: 4009-4014.

4. Zhao Z^#, Xie X^#, Liu W, Huang J, Tan J, Yu H, Zong W, Tang J, Zhao Y, Xue Y, Chu Z, Chen L, Liu Y-G*. STI PCR: an efficient method for amplification and de novo synthesis of long DNA sequences. Molecular Plant, 2022, 15(4):620-629.

5. Xie X, Liu Y-G*, De novo domestication towards new crops, National Science Review, 2021, nwab033, https://doi.org/10.1093/nsr/nwab033.

6. 谢先荣, 曾栋昌, 谭健韬, 祝钦泷, 刘耀光, 基于CRISPR编辑系统的DNA片段删除技术, 植物学报, 2021, 56(1): 44–49.

7. Xie X^#, Du H^#, Tang H, Tang J, Tan X, Liu W, Li T, Lin Z, Liang C*, Liu Y-G*, A chromosome-level genome assembly of the wild rice Oryza rufipogon facilitates tracing the origins of Asian cultivated rice. Science China Life Sciences, 2021, 64(2): 282–293.

8. Xie X, Liu W, Dong G, Zhu Q, Liu Y-G*. MMEJ-KO: a web tool for designing paired CRISPR guide RNAs for microhomology-mediated end joining fragment deletion. Science China Life Sciences, 2020, doi:10.1007/s11427-020-1797-3.

9.  Xie X^#, Zhang Z^#, Zhao Z, Xie Y, Li H, Ma X, Liu Y-G, Chen L*. The mitochondrial aldehyde dehydrogenase OsALDH2b negatively regulates tapetum degeneration in rice. Journal of Experimental Botany, 2020,71(9): 2551–2560. 

10. Xie X, Ma X, Liu Y-G*. Decoding Sanger Sequencing Chromatograms from CRISPR-Induced Mutations. In: Qi Y. (eds) Plant Genome Editing with CRISPR Systems. Methods in Molecular Biology, 2019, vol 1917. Humana Press, New York, NY.

11. Xie Y^#, Tang J^#, Xie X, Li X, Huang J, Fei Y, Han J, Chen S, Tang H, Zhao X, Tao D, Xu P, Liu Y-G, Chen L*. An asymmetric allelic interaction drives allele transmission bias in interspecific rice hybrids. Nature Communications, 2019, 10: 2501.

12. Xie X, Ma X, Zhu Q, Zeng D, Li G, Liu Y-G*. CRISPR-GE: A Convenient Software Toolkit for CRISPR-Based Genome Editing. Molecular Plant, 2017, 10 (9): 1246–1249.

13. Tang H, Zheng X, Li C, Xie X, Chen Y, Chen L, Zhao X, Zheng H, Zhou J, Ye S, Guo J*, Liu YG*. Multi-step formation, evolution, and functionalization of new cytoplasmic male sterility genes in the plant mitochondrial genomes. Cell Research,2017, 27 (1): 130-146.

14. Liu W^#, Xie X^#, Ma X, Li J, Chen J, and Liu Y-G*. 2015. DSDecode: A Web-based Tool for Decoding of Sequencing Chromatograms for Genotyping of Targeted Mutations. Molelcular Plant, 2015, 8 (9): 1431-1433.

15. Zhu Q, Xie X, Lin H, Sui S, Shen R, Yang Z, Lu K, Li M*, Liu Y-G*. Isolation and Functional Characterization of a Phenylalanine Ammonia-Lyase Gene (SsPAL1) from Coleus (Solenostemon scutellarioides (L.) Codd). Molecules, 2015, 20 (9): 16833-16851.

16.  Zhu Q*, Xie X, Zhang J, Xiang G, Li Y, Wu H. In Silico Analysis of a MRP transporter gene reveals its possible role in anthocyanins or flavonoids transport in Oryze sativa. American Journal of Plant Sciences, 2013, 4 (3): 555-560.

荣誉和奖励

1. 2017年，高效的植物基因组编辑载体系统和软件工具包及其应用，第十届大北农科技奖基因工程奖（独享），排名第三。

2. 2017年，第十八届全国植物基因组学大会墙报展一等奖。

发明专利

1. 谢先荣，湛浩然，毛宜军，李建裕，谭习羽，曾婉泳. 一种基于机器视觉的种子计数和尺寸测量方法，专利申请号：202310219375.6

2. 谢先荣，刘键鸿，刘耀光. 基因表达矩阵在线交互式分析方法、装置、设备及介质，专利申请号：2024102996769.9

3. 谢先荣，曾婉泳，谭习羽，林展生，刘耀光，郭晶心，初志战. 水稻 OsFD1 基因启动子区的 STR 或靶向删除该 STR 的方法在水稻分子育种中的应用，专利申请号：2024102997352.2

软件著作权

1. 谢先荣，刘耀光，马兴亮.  Degenerate Sequence Decode简并序列解码软件 [简称：DSDecode软件] V1.0，软件版权登记号2016SR300487，授权日期2016.10.20。

2. 谢先荣，刘耀光，陈绍通，李福权. 基于微同源介导的片段删除靶点设计软件V1.0 [简称：MMEJ-KO]，软件版权登记号2022SR0222827，授权日期：2022.2.14。

3. 谢先荣，植物基因组碱基编辑靶点设计软件BEtarget，2022SR1440131，2022.11.1

4. 谢先荣，本地版高通量的突变解码软件HiDecode，2022SR1451630，2022.11.2

5. 谢先荣，基于微同源介导的片段删除靶点设计软件MMEJ-KO，2022SR0222827，2022.2.14