我院作物学科发展与学校的办学历程基本同步，其发端于1909年创办的广东全省农事试验场暨附设农业讲习所。早在上个世纪二十年代，我国“稻作科学之父”、华南农学院首任院长丁颖院士率先在国内开始了水稻育种与光温生态研究，在我国稻作史上第一个利用野生稻杂交培育出水稻新品种，奠定了作物学科发展的基础。
改革开放后，在卢永根院士带领下，作物学科建设取得显著成绩。1981年作物遗传育种、作物栽培学与耕作学两个二级学科获批全国第一批硕士学位授权点，1986年作物遗传育种二级学科获批博士学位授权点，1998年作物学获批一级学科博士学位授权点，1999年获批作物学博士后流动站。1999年作物遗传育种二级学科被评为农业部重点学科，2002年和2007年连续两次入选国家重点学科；2012年作物学一级学科入选广东省攀峰重点学科，2015年至今华南农业大学作物学科一直作为广东省高水平大学和广东省“冲补强”提升计划重点建设学科。
