张群洁

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张群洁

副研究员、硕士生导师
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个人简介


张群洁,女,汉族,19813月出生,云南临沧人,博士,副研究员,硕士生导师。目前已主持完成1项国家自然科学基金青年基金、合作主持1项广东省科技计划项目、参加国家和省部级等项目10余项。以第一作者和共同一作者共发表SCI论文9篇,IF >8的论文6篇;其中第一作者论文4篇,IF > 8的论文有2篇(其中一篇IF > 10),发表于PNASMolecular Plant等学科top期刊;获得软件著作权1项,申请中国和国际PCT发明专利3项,其中1项已获得授权。获得2017广东特支计划科技创新青年拔尖人才资助。


学习、工作经历

1999.09 - 2003.07  厦门大学生命科学学院,学士,导师:林益民

2006.09 - 2009.07  中科院昆明动物所结构生物信息学,硕士,导师:黄京飞

2011.09 - 2014.07 中科院昆明植物研究所,基因组学与生物信息学,博士,导师:高立志

2009.07 - 2011.08  中国科学院昆明植物研究所,研究助理 

2014.08 – 2019.12  广东省农业科学院农业生物基因研究中心  副研究员

2020.01 -----      华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心   副研究员

研究方向

长期从事植物基因组全基因组测序、比较基因组学研究。主要的研究对象是稻属AA基因组物种和山茶属物种。

主要承担科研项目

1. 国家自然科学基金青年基金, “LncRNA在稻属AA-基因组物种中序列与功能的进化研究31601045),2017-2019主持。

2. 广东省科技计划项目,高叶酸优良甜玉米品种培育及产业化2016B020233004),2016-2020项目丙方主持人。

3. 国家自然科学基金联合基金项目,基于代谢组学与全基因组关联分析解析云南三七重要农艺性状与代谢化合物及其优异种质资源的发掘利用U1902205),2019-2023,主要参与。

 代表性论文

1. Qun-Jie Zhang*, Ting Zhu*, En-Hua Xia* , et al.. & Gao, L. Z. (2014).  Rapid diversification of five Oryza AA genomes associated with rice adaptation. Proceedings of the National Academy of Sciences, 111(46): E4954-E4962 (IF = 9.423).

2. Qun-Jie Zhang*, Wei Li*, Kui Li*, et al... & Gao, L. Z. (2020). The Chromosome-Level Reference Genome of Tea Tree Unveils Recent Bursts of Non-autonomous LTR Retrotransposons to Drive Genome Size Evolution. Molecular Plant. DIO: 10.1016 / j.molp.2020.04.009. (IF = 12.084).

 3. Zhang, Q.J*. and Gao, L.Z. (2017) Rapid and recent evolution of LTR retrotransposons drives rice genome evolution during the speciation of AA- genome Oryza species. G3: Genes, Genomes, Genetics7(6): 1875-1885.

 4. Zhang, Q.J*. and Gao, L.Z.(2014) The complete chloroplast genome sequence of desert poplar (Populus euphratica).Mitochondrial DNA,Part A, 2016, 27(1): 721-723.

 5. Liu J*, Shi C*, Shi C C*, Li W*, Zhang, Q. J.*., ... & Gao, L. Z. (2020) The chromosome-based rubber tree genome provides new insights into spurge genome evolution and rubber biosynthesis[J]. Molecular Plant, 13(2): 336-350. (IF = 12.084).

 6. Shi C*, Li W*, Zhang Q J*, ... & Gao, L. Z. (2020) The draft genome sequence of an upland wild rice species, Oryza granulat. Scientific Data, 2020, 7(1): 1-12.

 7. Xie L*, Zhang Q.J, Cao J, et al. Effects of Warming and Nitrogen Addition on the Soil Bacterial Community in a Subtropical Chinese Fir Plantation. Forests, 2019, 10(10): 861.

 8. Zhang, D. *, Li, W. *, Xia, E. H. *, Zhang, Q. J. *, Liu, Y., Zhang, Y., ... & Gao, L. Z.(2017) The Medicinal Herb Panaxnotoginseng Genome Provides Insights into Ginsenoside Biosynthesis and Genome Evolution. Molecular Plant,. 10(6): 903-907. (IF = 9.703).

 9. En-Hua Xia*, Hai-Bin Zhang*, Jun Sheng*, Kui Li*, Qun-Jie Zhang*, ... & Gao, L. Z. (2017). The tea tree genome provides new insights into tea flavor and independent evolution of caffeine biosynthesis. Molecular Plant.10(6): 866-877; (IF = 9.703).

 10. Li W*, Li K*, Zhang Q J*, et al. (2019) Improved hybrid de novo genome assembly and annotation of African wild rice, Oryza longistaminata, from Illumina and PacBio sequencing reads.The Plant Genome, 2020: e20001.

 

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